南通河堤石籠網的用途是十分廣泛的，首先這種工具可以用于加固堤壩，保證一些水利設施的安全性。由于這類工具的抗沖刷能力十分顯著，所以它的應用范圍主要是在河壩水流比較湍急的地方，這類地點水速極快，特別是在下暴雨的時節，就更加容易發生危險，安置上這項工具，就增加了一份安全性，安心感。另外它阻擋了一大部分的水流沖刷，對于水利設施的使用年限也是有所提升的，畢竟可以減小湍急水流對其的危害。
河堤南通石籠網還有另一個主要的用途就是可以用來引導水流。因為如果原來河槽內的水流在短時間內開始發生增加，那么會形成巨大的沖擊效應，這種作用力會擊毀原有的河槽，那么在這條河道上的堤壩等就會有被沖毀的危險。適當時機使用石籠網改變水流流向，可以起到減少危險發生的作用。